USEARCH序列分析软件 睿驰科技正版代理

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USEARCH（Ultra-fast sequence analysis）是一款序列分析软件，在序列比对、聚类、操作等多领域被广泛的应用。在扩增子分析领域的OTU聚类非常受欢迎。该软件由Robert Edgar开发，在序列搜索、聚类、去重、去嵌合体等步骤的度以及效率上。

USEARCH的优点如下：

1.高通量搜索聚类

USEARCH是一个序列分析工具，拥有大量用户。UAEARCH比对速度是BLAST的10-1250倍，聚类速度是CD-HIT的1-1000倍。

2. 高的生产率和洞察力

USEARCH将不同的算法结合到一个具有出色文档和支持的软件包中，这样可以缩短您的学习曲线，减少为给定任务所需采取的步骤，并减少计算时间。USEARCH会鼓励您探索数据，获得新见解，并建议您使用较慢的工具可能没有尝试过的新分析。

3. 安装简单便捷，程序小巧，易用。

新功能包含：

1.Machine learning：机器学习，主要包括随机森林、多次交叉验证、OTU分类相关性，包括的命令有森林训练、森林分类和森林交叉验证

2.Improved cross-talk detection:改进嵌合体检测

3.Novel alpha diversity metrics：新增了两种Alpha多样性指数：Mirror estimator 、Singleton-free（FE）estimator

4.Octave plots for visualizing alpha diversity：Octave plots（八度图）展示Alpha 多样性，方便观察样品中真实序列、测序错误和嵌合体数量

5.Statistical significance of diversity differences between groups：样品组间多样性比较

6.Cross-validation by identity （CVI）：同一性验证预测的率

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